Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms