Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FOXQ1Q9C009 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FOXQ1Q9C009 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FOXQ1Q9C009 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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FOXQ1Q9C009 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FOXQ1Q9C009 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXQ1Q9C009 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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