Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIM54Q9BYV2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIM54Q9BYV2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms