Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VN1R3Q9BXE9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms