Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RIOK2Q9BVS4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIOK2Q9BVS4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms