Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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C9orf16Q9BUW7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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