Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LPIN3Q9BQK8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms