Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LGMNQ99538 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LGMNQ99538 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms