Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSPG4P5Q96PW8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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