Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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C2orf48Q96LS8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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C2orf48Q96LS8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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C2orf48Q96LS8 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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C2orf48Q96LS8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
C2orf48Q96LS8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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