Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
UBE2E2Q96LR5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms