Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SERAC1Q96JX3 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms