Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAVIN3Q969G5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAVIN3Q969G5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms