Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TOPBP1Q92547 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms