Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms