Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC148Q8NFR7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC148Q8NFR7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC148Q8NFR7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC148Q8NFR7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms