Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPAP2Q8IXW5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms