Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC117Q8IWD4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC117Q8IWD4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms