Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SNX20Q7Z614 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SNX20Q7Z614 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SNX20Q7Z614 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SNX20Q7Z614 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SNX20Q7Z614 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNX20Q7Z614 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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