Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms