Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECW1Q76N89 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms