Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNE3Q6ZMZ3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms