Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC174Q6PII3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms