Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD54Q6NXT1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ANKRD54Q6NXT1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms