Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM208BQ5VWN6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms