Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PDZK1Q5T2W1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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PDZK1Q5T2W1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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PDZK1Q5T2W1 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PDZK1Q5T2W1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PDZK1Q5T2W1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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