Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMPD1Q5SYB0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMPD1Q5SYB0 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms