Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRAP1Q5SW96 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms