Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITRM1Q5JRX3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms