Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms