Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PTPROQ16827 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PTPROQ16827 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PTPROQ16827 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPROQ16827 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPROQ16827 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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