Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ECM1Q16610 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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ECM1Q16610 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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ECM1Q16610 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ECM1Q16610 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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