Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF239Q16600 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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