Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
E2F4Q16254 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
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E2F4Q16254 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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E2F4Q16254 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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E2F4Q16254 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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E2F4Q16254 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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E2F4Q16254 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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E2F4Q16254 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E2F4Q16254 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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