Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS72Q15906 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms