Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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CDSNQ15517 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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CDSNQ15517 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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CDSNQ15517 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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CDSNQ15517 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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CDSNQ15517 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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CDSNQ15517 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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CDSNQ15517 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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CDSNQ15517 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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CDSNQ15517 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDSNQ15517 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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