Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SKIV2LQ15477 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms