Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNIP1Q15025 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms