Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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LAPTM4AQ15012 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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LAPTM4AQ15012 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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LAPTM4AQ15012 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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LAPTM4AQ15012 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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LAPTM4AQ15012 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LAPTM4AQ15012 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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