Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NCAPHQ15003 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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