Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMCO1Q147U7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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