Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RFTN1Q14699 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms