Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK13Q14004 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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