Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CUL1Q13616 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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