Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNASE1L3Q13609 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNASE1L3Q13609 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms