Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 APOBEC3H-204ENST00000442487 988 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CCT6P3-203ENST00000452026 1383 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 AC017002.5-201ENST00000630717 871 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MKRN4PQ13434 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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