Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCOF1Q13428 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCOF1Q13428 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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