Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XRCC4Q13426 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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