Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SRSF6Q13247 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms