Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NFX1Q12986 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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